Crows nix mengisahkan tentang siswa sma pindahan bernama takiya genji (shun oguri) di suzuran all-boys high school, sebuah lembaga terkenal karena kekerasan. Selama orientasi, yakuza tiba di sekolah mencari serizawa tamao (takayuki yamada). Para preman salah mengira genji adalah target mereka lalu menyerangnya. Ketika tiba di sekolah, serizawa melihat genji mengalahkan para yakuza.
